Эпигенетика. Биология, 11 сынып, презентация.

Оқу мақсаты:

11.4.4.2 гендердің реттілігін бұзбайтын, гендерді реттеудің механизмін зерттеудегі эпигенетиканың маңызын түсіндіру

ДНҚ метилизациясы дегеніміз не?

МеДНҚ метилизациясы - өсімдіктер мен сүтқоректілерде эпигенетикалық ақпаратты берудің негізгі әдісі.

Бұл өзара әрекеттесу қабілетіне кедергі келтірмейді, бірақ ДНҚ қос спиртін тұрақтандырады және көптеген ақуыздармен танылады

Цитозин және аденин метиляциясы

Распространенность метилирования у разных организмов

Метилденген цитозинмен зарарсыздандыру

Метилденген цитозиннің «өздігінен» дегаминденуі нәтижесінде тимин пайда болады, бұл ДНҚ репликациясы кезінде түзілетін мутацияға әкеледі

Дәл осындай жағдай геномдарда болады, нәтижесінде CpG мотивтері жойылады (өсімдіктерде - CpNpG)

CpG островки

CpG аралының анықтамалары:

> 200 а.к., көпшілігінің ұзындығы -0,5-3 bp.

Салыстырмалы түрде жоғары GC құрамы (> 50, әдетте> 60%), CpG мотивінің тығыз орналасуы (бір баррелге, геномның орташа деңгейінен 10-20 есе жоғары) және оның статистикалық көрінісі

Әдетте CCGCCC мотивтері болады (SP1 байланыстыратын транскрипция факторы)

Адамда шамамен 45000 арал бар. Гендердің 60% -ында CpG локусы бар кем дегенде бір арал бар. Барлық гендерде «үй шаруасы» бар.

CpGның қасиеттері

Метилляция транскрипциясының репрессиялық механизмдері

Тікелей беріліс

Метил топтары ДНҚ-протеиннің өзара әрекеттесуін бұзады, ДНҚ-ның үлкен ойықтарында әрекет етеді және транскрипцияның нақты факторларының байланыстырылуына жол бермейді.

Кейбір ТҚ-да, керісінше, метилденген учаскелерге жақындасу байқалады.

Метил сезімтал

AP-2, E2F, NFkB, CREB, Myc / Myn

Метил сезімтал емес

SP-1, CTF

 Жанама механизм

Метилденген ДНҚ аймақтарында MBD (метилді байланыстыратын домен) байланыстырылады - құрамында транскрипциялық репрессорларды немесе гистондарды өзгертетін белоктар бар.

Құрамында MBD белоктарының көпшілігі транскрипциялық репрессорлар немесе корепресорлар болып табылады.

Арабидопс зат есімі 12 МВД - құрамында белоктар бар.

Құрамында ақуыз бар MBD бар гистон деацетилазалары (репрессорлар) бар кешендер түзілуі мүмкін.

Геномдық метиляцияға талдау

Метиляцияның көп бөлігі (эритроциттердің) алғашқы эмбриогенезінде деметиляция және / немесе метил топтарының гидроксилденуіне байланысты «жойылады»

Геномның метиляциясы заңдылығы (метилденген негіздердің таралуы) әр ұрпақта қалпына келтірілді, негізінен ол мұрагерлікке жатпайды, бірақ ерекшеліктер бар

Белгіленгеннен кейін, геннің экспрессиясының ерекшелігін қамтамасыз ететін жасушалардың ұрпақтары арасында метиляцияның нақты үлгілері сақталады

Осылайша, ұрпақтар ауысқан кезде циклдік циклдік метилляция / деметилляция геномның көптеген позицияларында жүреді

Қатерлі ісік метиляциясы

Ісік процестері негізгі супрессорлы гендердің гиперметиляциясымен және бірқатар онкогендердің (раф, с-фос, с-микс, с-Харас, кК-рас), өсу факторларының (IGF2, TGF) және гиперметиляциямен белсенді орналасуымен гипометриялануымен сипатталады. гетерохроматин аймақтарында.